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探索高效生物信息学绘图工具,轻松掌握专业分析技能

各位老铁们好,相信很多人对探索高效生物信息学绘图工具,轻松掌握专业分析技能都不是特别的了解,因此呢,今天就来为大家分享下关于探索高效生物信息学绘图工具,轻松掌握专业分析技能以及的问题知识,还望可以帮助大家,解决大家的一些困惑,下面一起来看看吧!

网址:https://www.xiantao.love/

目前,仙桃学术有5大模块:

仙桃文献:可以快速检索文献,方法和结果与Pubmed类似;

生物信息学工具:可以进行一些常见的生物信息学统计分析,并将结果可视化,帮助科研人员快速完成生物信息学分析,免去学习R语言的麻烦;

写作工具:论文写作辅助工具。输入中文进行句子检索,可快速匹配选定的英文SCI例句并显示句子用法的上下文,大大提高英语写作效率;

数据集检索:可检索分析数据集,一站式完成数据检索和分析;

数据库索引:可以索引常用的生物医学数据库。

1. 仙桃文献

我认为生物医学研究者最常用的文献检索工具是PubMed,但是PubMed的检索结果缺乏一些文献的基本信息,比如影响因子、期刊分区等。使用仙桃文献进行文献检索是非常友好,界面也非常简单。在搜索框中,您可以通过“英文关键词”、“英文标题”、“DOI”、“PMID”、“搜索词”等常用搜索方式进行搜索。

搜索结果中会显示该文献对应的信息,包括影响因子、文献类型、PMID、DOI、期刊信息等。您还可以在界面左侧的过滤条件框中按影响因子、文献类型、发表时间对搜索结果进行过滤,更方便地找到您需要的文献。

2. 生信工具

仙桃学术最核心的模块是传记工具。使用该工具,无需学习R语言,即可轻松完成传记分析和绘图,几分钟内完成传记文章。

据官网介绍,仙桃市高校学生信息工具有四大亮点,非常契合其使用体验。你可以尝试一下。

最全面的生物信息分析模块持续更新

基础绘图、差异表达、富集分析、交互网络、临床意义5大功能类型以及22个常规分析模块已全部上线,满足TCGA数据库几乎所有常规分析需求。 GEO数据库数据清理和最新的生物信息分析例程模块未来将持续更新。

快速无脑输出出版物级图片

所有TCGA数据已清洗至服务器,可随时调用。常规分析和绘图速度极快,可以在几秒钟内快速生成图片。同时,所有工具分析结果均支持在线拼图,直接输出出版物级图像。

数据统计绘图参数灵活调整

该工具具有根据上传的数据自动匹配统计分析方法、图片风格等参数的功能。同时提供多种个性化参数调整功能,包括统计分析方法、图片配色、字体、文字内容等。

配套线上实战训练营长期开放

训练营是提高工具使用效率的最好方法。通过生化文章的转载、作业、问答等,全面了解如何使用生化工具的功能模块,达到快速发表生化分析文章的目的。

当然,我们更关心的是仙桃生信工具能够完成的绘图工作,可以分为七个模块:基础绘图、表达差异绘图、功能聚类绘图、交互网络绘图、临床意义绘图、数据集模块和实验分析模块。

基本绘图模块包括:生存曲线、相关性散点图、点图、线图、折线图、配对图、组比较图(点/箱/柱/小提琴图)、直方图(叠加/比例/分组)、Pod图、山图(直方图)(数据分布)、维恩图、UpSet 图(多组交集)、诊断ROC、时间依赖性ROC、森林图、误差条图、哑铃图、细胞毒性IC50 (OD)、相关热图、棒棒糖图、简单ID转换(人源)、饼图、雷达图、桑基图等。

表达差异模块包括:表达差异图、PCA图、火山图、复杂数值热图、环热图、聚类树状图等。

功能聚类模块包括:GO/KEGG富集分析(人源/小鼠/大鼠)、GO/KEGG可视化、GO/KEGG可视化网络、GOKEGG(联合logFC)分析、GSEA富集分析(可视化分析、山图)等。

交互网络模块包括:免疫浸润图(棒棒糖图/散点图/分组比较图)、分子相关性分析(散点图/单基因相关性分析/单基因相关性筛选)、DNA甲基化(分子表达相关性)、相关性可视化(和弦图)图)、STRING 蛋白质相互作用分析和高级网络图等。

临床意义模块包括:临床相关性分析、基线数据表、ROC曲线(自选变量)、Logistic回归分析(单基因Logistic回归)、预后分析(KM曲线/亚组KM图/时间依赖性ROC曲线/单基因|多因素Cox回归/预后列线图(Nomogram)/预后校准分析/校准可视化/风险评分/Lasso系数筛选/Lasso变量轨迹图/预后DVA图)等

数据集模块包括样本归一化箱线图、PCA图、UMAP图、火山图、热图等。

实验分析模块包括qPCR实验分析和可视化。

下面我们以绘制诊断ROC曲线为例,演示如何使用仙桃市高校学生信息工具完成绘制。

在界面左侧导航栏中选择您要绘制的图片类型,然后上传您自己的数据文件。在参数面板中可以修改绘制图形的样式,如线条粗细、标题、图例等。仙桃学术学生信工具还提供了多种配色方案可供选择。每个方案都很漂亮,并且可以一键应用。设置完成后,点击“确认”按钮即可绘制图表。

绘图完成后,您可以直接查看绘图结果并选择您需要下载的格式。图片格式能够满足期刊要求,基本不需要二次处理。是不是很方便呢?

3. 写作工具

写作工具提供的“上下文”功能可以方便我们查看例句在原文档中出现的段落,帮助我们更好地理解例句的上下文和使用场景。点击任意例句,直接将其显示在右侧的写作区域,方便我们整理思路,完成论文写作。

相关问答

问:这“绘图神器”到底多强?能替代R语言学习吗?
2个回答
代价是折磨╳

答: 这款绘图神器不仅可以快速生成各种精美的生物信息图表,还能提供便捷的生物数据处理功能。它简化了绘图流程,即使没有R语言基础也能轻松上手,大大提高了研究效率。

201 人赞同了该回答

大王派我来巡山!

答: 此外,这款神器紧跟时代趋势,支持最新的生物数据分析方法和多种交互式可视化形式,为科研人员提供了更直观、更深入的数据解读。不过,R语言毕竟是一门强大的工具,掌握它仍然具有很多优势,比如灵活度更高、可定制性强等等。

201 人赞同了该回答

问:这款神器适合哪些人?
2个回答
轨迹!

答: 这款神器最适合对生物信息图表需求量大且对数据可视化效率有追求的研究人员。例如,从事基因组学、蛋白质组学等领域的科研工作者,或是需要进行生信分析并生成报告的专业人士

80 人赞同了该回答

发型不乱一切好办

答: 当然,即使没有深度生物信息学背景,只要对数据可视化和图表表达感兴趣的人也能尝试,因为它提供直观的操作界面并且无需复杂代码编写。

253 人赞同了该回答

问:使用这款神器有哪些好处?
2个回答
万象皆为过客

答: 它最大的优势就是高效便捷,能节省大量时间成本。与传统R语言分析相比,操作更简单,上手更快,只需要简单的拖拽和配置即可生成高质量图表。而且,它自带多种预设模板和分析模型,方便用户快速完成数据可视化任务。

120 人赞同了该回答

我怕疼别碰我伤口

答: 其次,它能够提供更加直观、易于理解的图表呈现形式,帮助研究人员更轻松地解读数据规律和发现潜在关联性。还可以将生成的图表直接分享到报告或论文中,提高科研工作效率。

17 人赞同了该回答

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